液相芯片技术快速检测CYP2C9、CYP2C19、CYP4F2、VKORC1及ABCB1基因多态性

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目的

基于液相芯片技术,建立一种可同时、快速检测细胞色素P450 2C9(cytochrome P450 2C9, CYP2C9)、CYP2C19CYP4F2、维生素K环氧化物还原酶(vitamin K epoxide reductase, VKORC1)及ATP结合盒亚家族B成员1(ATP-binding cassette subfamily B member1, ABCB1)等与华法林和氯吡格雷相关药物基因多态性的方法。

方法

方法学的建立。从Genbank中查找与华法林和氯吡格雷药物相关的8个靶位点附近基因序列,设计特异性引物和探针;通过多重PCR扩增,等位基因特异性引物延伸(allele specific primer extension, ASPE),MagPlex-Tag微球杂交,经液相芯片系统Luminex 200检测荧光信号,确定基因型;优化反应体系并进行方法学评价。收集2017年6月至2018年12月东莞市厚街医院抗血栓治疗患者血液样本,共260例,采用建立的方法检测其8个靶位点,并与测序结果比较。

结果

本方法检测260例样本结果显示:纯合子荧光强度中位值(median fluorescence intensity, MFI)比率均>0.9或<0.1,杂合子MFI比率均在0.3~0.6之间;各基因型批内和批间变异系数分别低于6.4%和10.9%;所需DNA最低检测限为0.75 ng;260例样本的检测结果与测序结果完全一致。

结论

本研究采用液相芯片技术,成功建立了快速检测华法林和氯吡格雷相关药物基因型的方法。

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