【摘 要】
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为了研究烟草幼苗对弱光胁迫反应的分子机制,以‘云烟87’为材料,构建全光照和弱光处理条件下大十字期烟苗cDNA文库,利用Illumina测序技术进行转录组测序,筛选差异表达基因。结果表明:借助RNA-seq技术共筛选到2 956个DEGs,其中弱光相对于全光照表达上调的DEGs有691个,表达下调的DEGs为2 265个;通过GO功能分类和KEGG富集分析,将差异基因划分为30个功能类别和113个代谢途径,包括代谢进程、碳水化合物结合、核酸结合转录因子活性、水解酶活性、转录因子活性、催化活性、内质网蛋白质
【机 构】
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遵义师范学院生物与农业科技学院,遵义市第一人民医院
【基金项目】
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遵义市科技局联合科技研发资金项目(遵市科合计[2018]10号),遵义市创新人才团队培养项目(遵市科人才[2019]7号),遵义师范学院服务农村产业革命项目(遵师合农村产业字201910),遵义师范学院博士基金资助项目(遵师BS[2015]14号)共同资助,遵义师范学院2017学术新苗培养及创新探索专项项目培育项目(黔科合平台人才[2017年]5727-18号)。
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为了研究烟草幼苗对弱光胁迫反应的分子机制,以‘云烟87’为材料,构建全光照和弱光处理条件下大十字期烟苗cDNA文库,利用Illumina测序技术进行转录组测序,筛选差异表达基因。结果表明:借助RNA-seq技术共筛选到2 956个DEGs,其中弱光相对于全光照表达上调的DEGs有691个,表达下调的DEGs为2 265个;通过GO功能分类和KEGG富集分析,将差异基因划分为30个功能类别和113个代谢途径,包括代谢进程、碳水化合物结合、核酸结合转录因子活性、水解酶活性、转录因子活性、催化活性、内质网蛋白质
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