【摘 要】
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目的 运用网络药理学与分子对接的方法探索金银花-黄芪药对治疗骨髓炎可能的作用机制,为临床用药提供科学依据.方法 在TCMSP平台内检索金银花、黄芪的生物活性成分并进行筛选,同时在蛋白质数据库和相关基因数据库中检索骨髓炎的潜在靶点,构建Venny图寻找共同靶点;运用Cytoscape软件构建“药物成分-靶点-疾病”复杂网络关系图,通过Bisogenet软件、CytoNCA软件和Metascape数据库等进行蛋白互作关系分析、靶点基因功能富集分析和信号通路分析,并使用分子对接软件(AutoDock)将核心靶点
【机 构】
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河南中医药大学,河南郑州450046;河南省洛阳正骨医院/河南省骨科医院,河南洛阳471002;河南中医药大学,河南郑州450046;河南省洛阳正骨医院/河南省骨科医院,河南洛阳471002
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目的 运用网络药理学与分子对接的方法探索金银花-黄芪药对治疗骨髓炎可能的作用机制,为临床用药提供科学依据.方法 在TCMSP平台内检索金银花、黄芪的生物活性成分并进行筛选,同时在蛋白质数据库和相关基因数据库中检索骨髓炎的潜在靶点,构建Venny图寻找共同靶点;运用Cytoscape软件构建“药物成分-靶点-疾病”复杂网络关系图,通过Bisogenet软件、CytoNCA软件和Metascape数据库等进行蛋白互作关系分析、靶点基因功能富集分析和信号通路分析,并使用分子对接软件(AutoDock)将核心靶点与化合物进行分子对接,使用绘图软件Pymol将结果可视化.结果 本研究共纳入金银花的有效成分236种,黄芪有效成分87种,预测出可能的共同靶点21种.通过富集分析,显示金银花-黄芪药对中的有效成分能够影响多种蛋白质的表达,这些蛋白质又与骨髓炎的发生发展密切相关.分子对接结果显示金银花-黄芪药对的有效成分和靶点蛋白能够自发结合.结论 金银花-黄芪药对可从抗氧化应激、提高免疫力、减少细胞凋亡、抗炎抗菌4个途径发挥治疗作用,为治疗骨髓炎和新药开发提供了理论依据.
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