基于shotgun混合蛋白鉴定技术,系统研究海洋中药海螵蛸蛋白质类、肽类物质组成.以酸化甲醇提取海螵蛸粗多肽,采用强阳离子交换树脂(SCX)进一步富集其中多肽类成分;提取海螵蛸粗蛋白,通过胰蛋白酶(trypsin)酶解制备蛋白酶解液.采用nano-LC Q Exactive Orbitrap质谱仪分析鉴定海螵蛸蛋白质、肽类成分.基于软体动物门Mollusca蛋白质数据库比对分析,从海螵蛸中共鉴定出16个蛋白质类成分,168个多肽类成分,从头测序(De novo sequence)方法鉴定了328个多肽类成分.蛋白质类成分主要为血蓝蛋白(hemocyanin)、烯醇化酶(enolase)、肌球蛋白(myosin)、肌动蛋白(actin)、钙调蛋白(calmodulin)等;多肽类成分主要来源于肌动蛋白、组蛋白(histone)、微管蛋白(tubulin)等.这些蛋白质、肽类成分构成了海洋中药海螵蛸的重要物质基础.该文为海螵蛸的功效物质基础系统研究及反映传统功效的活性成分的发现提供理论依据与研究基础.