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[学位论文] 作者：孔韧,,
来源：北京工业大学 年份：2008
1983年,科学家Barre-Sinoussi等首次确认1型人类免疫缺陷病毒(Human Immunodeficiency virus 1, HIV-1)是引起获得性免疫缺陷综合症(Acquired immunodeficiency syndrome, AI...
[期刊论文] 作者：许晓双, 朴莲花, 孔韧,,
来源：江苏医药 年份：2004
蛋白质精氨酸甲基转移酶(PRMTs)主要负责催化蛋白质底物中精氨酸残基的甲基化,涉及转录、RNA剪接、DNA修复等多种重要的细胞过程。PRMTs的异常表达与肿瘤、乳腺癌和白血病等...
[期刊论文] 作者：许晓双,张大为,孔韧,
来源：生物学杂志 年份：2019
人转运蛋白SR2(TRN-SR2)与HIV-1整合酶(IN)相互作用是抗HIV治疗的有效靶点,寻找和设计该靶点的高效抑制剂具有重要的临床意义和广阔的应用前景。因此为了开展以TRN-SR2与HIV-...
[期刊论文] 作者：钦淳,许磊,王峰,孔韧,常珊,
来源：数据采集与处理 年份：2020
蛋白质种类和小分子的数量过多,对于药物的模拟开发运算量巨大。而分子对接是研究新药的重要手段,因此提高分子对接实验系统的工作效率十分重要。分子对接主要目的是研究蛋白...
[会议论文] 作者：丛肖静;孔韧;陈慰祖;王存新;,
来源：2008中国药学会学术年会暨第八届中国药师周 年份：2008
目的：合理设计新的以HIV-1跨膜蛋白gp41为靶点的抑制剂。 方法：采用两种分子对接方法研究gp41与其抑制剂NB-2的结合模式，利用从头药物设计方法(LeapFrog)改造NB-2的结构以设...
[期刊论文] 作者：陆旭峰, 陆振宇, 梅向东, 孔韧, 常珊,,
来源：数据采集与处理 年份：2018
分子对接是预测蛋白质复合物的有效手段。对于分子对接算法的优化旨在加速分子对接效率,降低计算成本,以及充分发挥计算资源的利用率。本文主要采用3个方案对半柔性对接算法...
[期刊论文] 作者：常珊,孔韧,李春华,陈慰祖,王存新,
来源：计算物理 年份：2008
基于消息传递接口（Message Passing Interface，MPI），用两种不同的并行程序设计方法对Autodock程序进行修改．将修改后的程序应用于HIV-1蛋白酶（Protease）和小分子抑制剂XK263的对接体...
[期刊论文] 作者：王存新,丛肖静,孔韧,谭建军,陈慰祖,,
来源：北京工业大学学报 年份：2010
为了设计以HIV-1跨膜蛋白gp41为靶点的抑制剂,采用分子对接、分子动力学模拟及自由能计算方法研究了gp41与其抑制剂NB-2的结合模式,利用从头药物设计方法,通过改造NB-2的结构...
[期刊论文] 作者：孔韧,徐雪梅,陈慰祖,王存新,胡利明,
来源：物理化学学报 年份：2007
吡咯烷与正丁烷类CCR5（化学趋化因子受体5）拮抗剂可通过抑制人类免疫缺陷病毒（HIV-1）包膜蛋白与CCR5的相互作用而阻断病毒进入细胞.本文使用已知拮抗剂结构和活性信息构建了一个......
[期刊论文] 作者：孔韧,徐雪梅,陈慰祖,王存新,胡利明,,
来源：物理化学学报 年份：2007
吡咯烷与正丁烷类CCR5(化学趋化因子受体5)拮抗剂可通过抑制人类免疫缺陷病毒(HIV-1)包膜蛋白与CCR5的相互作用而阻断病毒进入细胞.本文使用已知拮抗剂结构和活性信息构建了...
[会议论文] 作者：刘斌, 何红秋, 程绍辉, 孔韧, 陈慰祖, 王存新,,
来源： 年份：2004
HIV-1跨膜蛋白gp41在HIV-1包膜与靶细胞膜融合过程中发挥关键作用,是理想的HIV-1融合抑制剂靶点。为了开展以gp41为靶点的抑制剂筛选研究,本研究以HIV－1 B亚型病毒基因组为模...
[期刊论文] 作者：张大为,许晓双,孔韧,陆旭峰,陆振宇,常珊,,
来源：北京工业大学学报 年份：2017
为了探究蛋白质复合物的结构与相互作用,建立了蛋白质的分子对接方法,从2014年起参加蛋白质复合物结构预测竞赛的预测和打分竞赛.该方法首先采用结构模建方法预测单体蛋白质...
[期刊论文] 作者：陈舟,任丁,朴莲花,许晓双,常珊,刘继勇,孔韧,
来源：北京工业大学学报 年份：2017
药物与细胞膜的相互作用是决定药物在体内吸收、分布、代谢与排泄的关键因素之一,最终影响临床上的药效与毒副作用.对药物透膜过程的分子动力学模拟可在原子层面上提供药物与...
[期刊论文] 作者：徐浩,薛瑞,李娟,李波,陈舟,朴莲花,常珊,孔韧,
来源：江苏理工学院学报 年份：2021
通过使用分子对接与虚拟筛选技术,以SARS-CoV-2主蛋白酶(Main Protease,Mpro)为靶点,利用Autodock Vina软件和Python脚本进行分子对接,结合小分子的对接评分与结合模式分析,...
[期刊论文] 作者：许煌,许晓双,高英,曹依菁,黄险峰,孔韧,宋国强,
来源：中国新药杂志 年份：2020
目的:建立稳定可靠,且以二型磷酸二酯酶(PDE2)为靶标,采用AlphaScreen(R) cAMP kit为技术的高通量药物筛选模型.方法:利用大肠杆菌原核表达纯化获得目的蛋白,通过AlphaScreen...
[期刊论文] 作者：徐浩,薛瑞,李娟,李波,陈舟,朴莲花,常珊,孔韧(指导),
来源：江苏理工学院学报 年份：2021
通过使用分子对接与虚拟筛选技术,以SARS-CoV-2主蛋白酶(Main Protease,Mpro)为靶点,利用Autodock Vina软件和Python脚本进行分子对接,结合小分子的对接评分与结合模式分析,...
[会议论文] 作者：王存新,孔韧,马晓慧,谭建军,张小轶,何红秋,陈慰祖,
来源：第二届国际理论化学、分子模拟和生命科学研讨会暨第二届北京宏剑公司用户大会 年份：2006
本实验室以病毒生命周期中的新靶点整合酶和在病毒进入过程中发挥重要作用的病毒膜蛋白进行了一系列抗病毒药物分子设计的基础及应用研究。...
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