【摘 要】
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本研究采用SMART-RACE法首次从仿刺参(Apostichopus japonicus)中克隆出仿刺参核糖体蛋白L17(ribosomal protein L17,RPL17)基因的全长cDNA序列,并对该序列进行了生物信
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本研究采用SMART-RACE法首次从仿刺参(Apostichopus japonicus)中克隆出仿刺参核糖体蛋白L17(ribosomal protein L17,RPL17)基因的全长cDNA序列,并对该序列进行了生物信息学分析。结果表明:仿刺参RPL17(GenBank登录号:JQ922561)仿刺参RPL17的cDNA全长643 bp,包括33 bp的5-UTR,58 bp的3-UTR,开放阅读框552 bp,编码183个氨基酸,并含有4个功能位点,分别为2个cAMP和cGMP依赖性蛋白激酶磷酸化位点,2个蛋白激酶C磷酸化位点,2个酪氨酸激酶Ⅱ磷酸化位点,1个核糖体蛋白L22信号位点。编码的氨基酸序列与紫海胆、大西洋鲑、牛、人的同源性分别为83%、78%、77%、78%,其中与紫海胆的RPL17基因所编码的氨基酸序列同源性最高,为83%。构建系统进化树结果显示仿刺参RPL17序列与紫海胆的RPL17-1ike亲缘关系最近,在分子进化地位上与其生物学分类一致。这些结果为进一步研究RPL17基因及其在仿刺参再生过程中的作用奠定了基础。
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