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芽孢杆菌作为重要的植物根际促生菌(Plant Growth-Promoting Rhizobacteria,PGPR),在促进植物生长和维持植物健康中发挥重要作用,以其开发的生物肥料和生物农药对减少农用化学品投入、促进农业可持续发展提供技术支撑。本研究对分别分离自不同植物(黄瓜、香蕉、棉花)三株根际有益芽孢杆菌进行了全基因组测序和功能基因组研究,在根系分泌物增强根际定殖和生物膜形成的基础上,解析了分离自黄瓜根际的的解淀粉芽孢杆菌SQR9 (Bacillus amyloliquefaciens SQR9)对根系分泌物组分的转录组反应。盆栽试验和田间试验证明SQR9具有显著的促进作物生长和抑制土传病原菌的效果。