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本研究旨在考察纤维消化力不同的山羊瘤胃微生物结构与组成的差异性。选取19只1.5岁的健康山羊为实验动物,饲喂同一种日粮,预饲14天后进行6天的消化试验。计算山羊各个个体及群体对日粮中营养物质的消化率,将粗纤维(CF)消化率大于群体平均值+0.5×标准差的5只山羊视为高纤维消化力组(HFD),将CF消化率小于群体平均值-0.5×标准差的5只山羊作为低纤维消化力组(LFD)。消化试验结束的次日晨饲前采集HFD组和LFD组瘤胃内容物,提取其中微生物总DNA,用微生物通用引物对,针对微生物16S rRNA的高可变区进行PCR扩增,用Illuminas Miseq250PE测序平台对扩增产物进行高通量测序,用QIIME等软件对测序序列进行生物信息分析。结果显示:1)HFD组Chloroflex(门)、Acidobacteria-6(纲)、Actinobacteria(纲)、Anaerolineae(纲)、Gammaproteobacteria(纲)、Bacilli(纲)、iii1-15(目)、SBR1031(目)、Enterobacteriales(目)、Lactobacillales(目)、Enterobacteriaceae(科)、Piscirickettsiaceae(科)、Nitrososphaeraceae(科)、拟杆菌科、肠球菌科、乳酸杆菌科和韦荣氏球菌科的相对丰度显著低于LFD组(P<0.05),而Crenarchaeota(门)、Thaumarchaeota(纲)、Nitrososphaerales(目)和WD2101(目)的相对丰度极显著低于LFD组(P<0.01)。2)在属水平,HFD组和LFD组共被注释到了857个菌属,其中共享属有69个。两组的优势菌属均为普雷沃氏属,且组间丰度差异不显著(P>0.05)。HFD组*Enterobacteriaceae,拟杆菌属,5-7N15,厚壁菌门的肠球菌科下的other菌属,乳酸菌属和韦荣氏球菌属的相对丰度均显著低于LFD组(P<0.05);Piscirickettsiaceae和Candidatus Nitrososphaera菌属的相对丰度极显著低于LFD组(P<0.01)。3)组间相对丰度差异显著的菌群和CF消化率间的回归分析表明:Bacteroidaceae(科)、Lactobacillus(属)、Bacteroides(属)、5-7N15(属)和Kaistobacter(属)的相对丰度与CF的消化率显著正相关(P<0.05),而Crenarchaeota(门)、Thaumarchaeota(纲)、Nitrososphaerales(纲)、Lactobacillaceae(科)、Nitrososphaeraceae(科)、Enterococcaceae、Veillonella(属)和Piscirickettsiaceae(属)的相对丰度与CF消化率均显著负相关(P<0.05)。由此可见,不同纤维消化力的山羊瘤胃微生物的结构与组成存在显著性差异。山羊瘤胃微生物中有1个门,2个纲,3个科和7个属的相对丰度与山羊对CF的消化率之间存在显著相关关系。