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短叶对齿藓是黄土丘陵区的苔藓植物优势种之一，该地区的苔藓植物形成大面积生物结皮层，是防止水土流失的重要植物类群，其构成的微生境又是此地微生物种类最丰富的环境之一。内生细菌相关研究多集中于种子植物，对苔藓植物相对较少，但苔藓植物体结构给予内生细菌较为特殊的定植基质，因此，定植在苔藓植物内部并适应这些特殊生态位的微生物资源值得深入探究。