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目的：找出公立医院与非公立医院的收支差异及其影响因素，为公立医院改革提供建议。
方法：对SM县的l所公立医院和1所非公立医院2006—2009年的收支结构及结余进行比较分析，结合方差分析方法，对公立医院和非公立医院的收支差异进行显著性分析。
结果：
(1)公立医院和非公立医院的年均药品收入占年均总收入的比例分别为49.87％和53.79％；
(2)公立医院的年均收入结余率为25.21％，低于非公立医院的46.34％；
(3)公立医院和非公立医院在每门诊次均费用、住院药品收入占总收入的比例和收入结余率等7个方面有显著性差异。
结论：
(1)公立医院的医院规模和医疗服务量大；
(2)公立医院的支出结构不稳定，不利于成本核算；
(3)加大财政补助力度，防止公立医院提供公益性医疗服务积极性受挫。