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得益于多国学者的合作,真菌生命之树(AFTOL)项目进展喜人,取得一系列成果,发表了多篇产生重要影响的论文.子囊菌门的系统发育树整体上有了显著的提高,纲以上分类群的系统地位趋于稳定,基本反应了子囊菌生殖、生态和营养方式的起源、演化和适应.近期对该项目采用的6个核心基因(The 6 Core AFTOL Genes： RPB2,RPB1,TEF1,mt SSU,nLSU和nSSU)所贡献的系统发育信息量分析显示,RPB2最多,而nSSU最少.选择地衣型子囊菌重要类群30种,以模式生物脉孢菌和酿酒酵母为外群,获得RPB2基因矩阵,长度为1893 bp,超过酿酒酵母完整RPB2基因(GenBank： NM001183570,3675 bp)的50％, 较通常分析所用RPB2基因(约1350bp)长37％.使用BEAST,MEGA及PAML中的MCMCTREE等进行系统发育及分化时间分析.结果显示,茶渍纲(Lecanoromycetes)的主要类群在寒武纪物种大爆发时期出现；现存子囊地衣经由多次地衣化形成,如Euriotiomycetes中的瓶口衣目(Verrucariales),Lichinomycetes及茶渍纲等,而茶渍纲最近共同祖先的地衣化是最重要的一次,该纲中的已知物种数量占全部子囊地衣的95％,以这些类群地衣为主的植被占全球地面植被的8％；与蜈蚣衣科(Physciaceae)关系最近的是茶渍目中的类群,而不是黄枝衣目(Teloschistales)中的类群,将其隶属于黄枝衣目不合适,目前不同基因组合分析结果并不一致,应可建立一新目(Physciales ord.nov.)；瓶口衣目应可提升为纲,不适合置于Euriotiomycetes中；不支持目前茶渍纲中的亚纲设置,建议可不设亚纲,直接分为10-12个目.