转录组测序已成为精准药物研发的重要手段之一，很多大型药物基因组学研究项目(如LINCs[1]、CCLE[2])都通过转录组测序研究药物反应相关的基因表达特征和标志物。建立转录组RNA标准物质及相关质量控制方法对提高大型转录组测序项目的 数据质量非常重要，而RNA在长期、短期保存的稳定性是标准物质建立的前提，但目前尚缺少系统性的研究。
药物-药物相互作用引起的不良反应是致使药物研发提前终止以及药物退出市场的重要原因，而许多药物-药物相互作用是由细胞色素P450酶(CYP450)引起的。因此，准确预测给定化合物对CYP450酶特定亚型的抑制能力是非常必要的。
The Bcl-2 family consists of several proteins that share Bcl-2 homology(BH) domain and control apoptosis by governing mitochondrial outer membrane permeabilization(MOMP),which is a key step in the int
蛋白-蛋白相互作用(PPI)在各种生命活动中均扮演着至关重要的角色。因此，破解PPI中的结构信息可对其机制的研究以及相关药物的开发起到关键作用。然而至今为止，仅有一小部分的蛋白-蛋白复合物的晶体结构得到了解析。因此，越来越多的研究人员借助蛋白-蛋白对接方法进行PPI结构的预测。
卤键是一种常见的非共价键相互作用,具有由静电相互作用引起的高方向性,并且存在一个正的静电势区,称为σ-hole[1-2],目前主要用于分子识别,晶体材料和药物设计[3]。我们用量化计算方法对H2Te与二卤素分子XY(XY = F2,Cl2,Br2,I2,ClF,ClBr,BrF,BrCl,BrI,IF,ICl,IBr)形成的的卤键复合物进行了研究,为了探究甲基取代基对卤键强度和性质的影响[4],我
Protein tyrosine phosphatase 1B(PTP1B) is considered as a negative regulator of insulin signaling and an important target for the treatment of type Ⅱ diabetes and obesity.Inhibition of PTP1B can enhan
蛋白激酶CK2是重要的抗癌药物研发靶点[1]。然而,唯一进入临床Ⅱ期试验阶段的抑制剂CX-4945,是通过具有一定盲目性且命中率低的高通量筛选而获得[2],因此,高效的化合物筛选策略是该类抑制剂研发的关键。
组学分析以及基因测序等现代技术会产生大量的数据，为了从数据中获得能够服务于精准医疗与药物设计等研究工作的信息，需要简单方便的工具对数据进行分析和建模。本工作中，我们使用Python 语言以及多个函数库编写了一款开源的具有图形交互界面的基于多算法投票的自动化二分类建模软件。为了增强最终模型的泛化能力，我们将独立的人工神经网络(ANN)、随机森林(RF)和支持向量机(SVM)模型集成为一个一致性二分类
铜催化的叠氮-炔环加成类反应(CuAAC)是目前最受关注的一类点击化学反应.CuAAC的反应成功率不稳定.为了研究CuAAC类点击化学的反应可行性与化学结构之间的关系，我们设计并合成了700个三氮唑类化合物.基于这批数据，我们训练了结合自注意力机制的长短期记忆的模型(BiLSTM-SA)来预测点击化学反应的可及性(accessibility).
Poly(ADP-ribose) Polymerase1(PARP1) is one of the most investigated enzymes in 18 membered PARP families and is involved in a variety of cellular functions including DNA damage repair,gene transcripti