目前用于蛋白质组学研究的核心技术主要是双向电泳和质谱分析技术。应用蛋白质组学技术不但可以高通量发现不同细胞间蛋白质的变化，寻找肿瘤相关蛋白，进而分析肿瘤发生、发展的可能机制，而且可以通过特异性的差异蛋白作为疾病诊断治疗的分子标记。对病理组织细胞与正常组织细胞差异蛋白质表达的研究，是比较蛋白质组学的重要内容。皮肤鳞状细胞癌起源于表皮和皮肤附属器的角质形成细胞，是恶性度较高的皮肤非黑素瘤之一，其发生发展的机制还不十分清楚。HaCaT细胞是源于人类表皮的角质形成细胞系，SCL-1细胞是源于人皮肤鳞状细胞癌的角质形成细胞，因而它们分别是研究人类表皮角质形成细胞和皮肤鳞状细胞癌生物学的理想模型。本研究利用蛋白质组学核心技术双向电泳(2-DE)、串联质谱及生物信息学技术分析和鉴定HaCaT细胞和SCL-1细胞的差异蛋白，为筛选皮肤鳞癌相关蛋白提供依据。