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以非抗螨、非抗蚜陆地棉品种(系)及3个种外材料为对照，利用RAPD标记技术对育成抗螨、抗蚜棉花品种(系)进行遗传差异性分析。从80条中筛选出17条能揭示供试材料遗传多态性的RAPD引物，17条引物共扩增出了93条带，其中具有多态性的有85条。采用Jaccard’s相似系数，非加权维平均法(UPGMA)聚类，结果表明，16个棉花材料基本按照抗螨、抗蚜、种外材料分别聚在一起。材料之间的相似系数变幅较大，遗传相似系数在O.254～O.910。其中抗螨材料与抗蚜材料之间存在一定的遗传差异(0.603～0.819)。聚类结果分析及遗传相似系数分析与材料来源的系谱相符，为抗虫育种的种质资源利用与棉花抗螨、抗蚜的分子标记辅助育种提供指导。