橡胶树白粉菌真核表达启动子的预测、克隆及功能鉴定

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启动子是最重要的基因调控序列之一,正确定位基因转录起始位点和核心启动子是理解转录调控机制的重要方面。本实验室从2010年开始橡胶树白粉病菌分子致病机理的研究,以橡胶树无性系热研7-33-97为寄主材料,单斑菌株HO-73为O.heveae靶标菌,首次基本完成了橡胶树白粉菌HO-73基因组的测序工作,基因组组装大小为53.4M,已得到橡胶树白粉菌主要基因编码区域。Gene Ontology(GO)注释基因3 890个,其中涉及31 1条KEG代谢途径,低于大麦白粉菌5 854个基因的水平。在GO level 3水平上预测致病相关基因30个,少于稻瘟病菌的136个,仅占注释基因的0.6%。0hpi、24hpi、3dpi、30dpi、rubber leaves 5个转录组文库,GO注释基因6 910个,共筛选出橡胶树白粉菌差异表达基因2 169个。利用Promoter Scan等在线启动子预测软件预测启动子,通过TATA框、CAAT框、TSS以及CTF、HNF1、NF1、Oct、SRF、TFIID、MLTF、ATF、EIIF、Sp1、NFI、TFIID、GCF等显著信号的定位和分析我们预测得到疑似启动子62个,筛选后现已成功构建重组载体7个,三亲杂交转入农杆菌LBA4404后以叶盘法转入烟草进行了瞬时表达。
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