葱蝇PDK1基因的克隆和生物信息学分析

来源 :重庆市昆虫学会2013年学术交流及研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:kevinchen12344
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3-磷酸肌醇依赖性蛋白激酶1(3-phosphoinositide-dependent protein kinase1,PDK1)是磷脂酰肌醇3-激酶(phosphatidylinositol-3 kinase,PI3K)/蛋白激B(PKB/Akt)信号通路中一个关键的激酶.该通路在人、果蝇、线虫中是一条保守的通路,通过激活下游的因子从而对代谢、细胞分化、寿命等产生重要调节作用.本研究基于葱蝇(Delia antiqua)转录组测序数据通过生物信息学分析从其中鉴定出PDK14个Unigene序列,基于这4个序列设计出了特异性引物并通过PCR技术克隆了葱蝇PDK1基因全长cDNA,命名为DaPDK1,其全长为3215 bp,开放阅读框长2730 bp,编码909个氨基酸.采用生物信息学的方法,推测该基因编码的蛋白质相对分子质量为100.3kD,等电点为8.53.该蛋白第87~109氨基酸是跨膜信号区,第284~627和744~833氨基酸是两个保守结构域STKc和PH.与10个物种PDKl氨基酸序列的同源性分析表明,和地中海实蝇PDK1氨基酸序列相似性最高(Identity=53.1%,Similarity=63.2%).为进一步研究葱蝇P13K/Akt信号通路PDK1基因的特性及功能奠定了基础。
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