葱蝇过氧化氢酶基因的克隆及生物信息学分析

来源 :重庆市昆虫学会2013年学术交流及研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:mayf014
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过氧化氢酶(catalase,CAT)对昆虫的生长发育和代谢活动具有重要意义,是昆虫清除H2O2的关键酶.昆虫在滞育期间代谢速率很低,而CAT的活力与代谢强度有关,因此滞育期的昆虫是研究该酶的良好材料.本研究基于葱蝇转录组unigene序列信息,设计特异性引物并首次通过PCR技术克隆了葱蝇过氧化氢酶基因全长cDNA,命名为DaCAT,其全长为2073bp,开放阅读框1518bp,编码505个氨基酸,推测其相对分子质量为56.8kD,等电点为7.72.对其进行了生物信息学分析并建立了系统发育树,分析表明该基因编码的氨基酸序列具有两个保守结构域及多个酶活性位点,与其它物种CAT具有较高的同源性,其中和拟果蝇Drosophila simulans亲缘关系最近,相似率为89.3%,采用SWISS-MODEL对其进行了蛋白质同源建模及3D结构预测分析。为进一步研究DaCAT基因在葱蝇滞育期间的代谢表达、酶活力测定以及具体功能奠定了基础。
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