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柳树(Salix spp.)物种丰富,全世界约有520多种,包括垫状灌木、灌木、小乔木及乔木等多种生活型.柳树的栽培和利用历史悠久,古代主要应用于编筐、栅栏、防护架和医药等方面.随着世界能源危机形势日益严峻,一些生长速度快、生物量高的短轮伐期矮生(short-rotationcoppice,SRC)柳树作为重要的生物质能源树种,广泛应用于生物能源发电和生物燃料的制备等方面.此外,柳树可用作生物滤池,在过滤废水、降解有机粒子、吸收重金属等方面发挥着非常重要的作用.目前,国内外对于柳树的研究多数局限于常规杂交育种及优良无性系选育方面,分子遗传学方面的研究较少;柳树品种的鉴定多数是从形态学方面进行区分,基因组水平上的研究较少.本研究利用毛细管电泳-AFLP(Capillary electrophoresis-amplified fragment length polymorphism,CE-AFLP)技术,采用EcoR I+3/Mse I+3和PstI+2/Mse I+3引物组合对37份柳树材料进行遗传多样性分析.结果表明:从60对引物组合中筛选出11对扩增条带数目多、稳定且多态性高的引物进行扩增,共获得条带数1587条,多态性条带数1406条,多态率在80.95%-94.15%之间;平均每对引物组合扩增条带数143.3条,多态性条带数127.8条,多态率为88.59%.采用NTSYS-pc 2.10e软件进行聚类分析,遗传相似系数在0.61-0.99之间,当遗传相似性阀值取0.61时,37份材料聚为两大类,一类是乔木柳,另一类是灌木柳.乔木柳包含柳组的9份材料、柳组内杂交种的5份材料、竹柳和Dr,共16份材料.灌木柳包含21份材料,在相似系数为0.69时,康定柳与其它灌木柳分开,单独聚为一类;绵毛柳组的3份材料在相似系数为0.71时,聚为一类;沙柳、簸箕柳P295、银芽柳、杞柳、杞簸柳Jw9-6、簸杞柳Jw8-26、红柳在相似系数为0.78时聚为一类,其中杞簸柳Jw9-6和簸杞柳Jw8-26亲缘关系较近;其中蒿柳组的6份材料在相似系数为0.83时,聚为一类,其中英国蒿柳P683和德国蒿柳的优良品系在相似系数为0.83时分开,说明蒿柳在不同区域环境内遗传背景差异较大.本研究从基因组水平上研究37份柳树材料的遗传多样性和亲缘关系,为柳树育种提供科学的理论依据.