microRNA碱基编辑在不同蜱种间的差异特征分析

来源 :中国畜牧兽医学会兽医寄生虫学分会第十三次学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hewanjiang1975
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  保守microRNA(miRNA)是在真核生物中发现的一类内源性的具有调控功能的非编码RNA,其大小长约20~25个核苷酸,广泛存在于动植物细胞中.miRNA通过"种子序列"实现对靶标基因的识别,因此,其具有高度保守性.miRNA通过碱基编辑对多个靶标基因进行调控,这一现象决定了miRNA的多样性.为了分析蜱miRNA碱基编辑特征,利用高通量测序方法对我国五个主要的蜱种(微小牛蜱,长角血蜱,银盾革蜱,小亚璃眼蜱,血红扇头蜱)进行miRNA测序.并将未注释上的小片段RNA序列与miRBase21(http://www.mirbase.org/index.shtml)中已知成熟miRNA序列进行比对(只允许在特定位点的错配)来找出发生了碱基突变的miRNA.
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