怀牛膝属于牛膝属苋科,是一种多年生草本植物,为“四大怀药”之一,主产于河南温县、武陟等地.据《中国药典》记载,其根部经炮制后即可入药,具有补肝肾、散淤血、填精补髓之功效.本研究以不同连作年限怀牛膝根际土壤为材料,样品设置为连作1年牛膝土壤(1Y)、连作10年(10Y)、连作30年(30Y),未种怀牛膝的对照(CK).采用16S rDNA PCR-DGGE和amoA PCR-DGGE分析了不同处理土壤氨氧化细菌(Ammonia-oxidizing bacteria,AOB)多样性指数和群落变化.通过对DGGE图谱进行Shannon和Evenness指数分析,结果表明怀牛膝连作会促使AOB多样性指数变化明显,其中10Y和30Y处理显著高于其他处理(P＜0.05);主成分分析结果表明,CK与1Y根际土壤中AOB群落结构差异较小、10Y与30Y根际土壤中AOB群落结构较为接近,但CK、1Y与10Y、30Y的AOB群落结构差异较大.amoA基因测序与系统发育树的构建显示,不同连作年限怀牛膝根际土壤的AOB一部分属于已报道的AOB类群,一部分未知.另外,在本次所检测的AOB优势条带中,部分在文献中无记录和归类,包括10Y特有条带12、13和14,30Y特有条带5、7、8和9以及10Y、30Y共有条带2、3和4.综上分析,不同连作年限怀牛膝对土壤根际AOB多样性有显著影响,并改变AOB群落结构的组成.