目的：研究国家基本药物制度实施前后乡镇卫生院服务量和患者费用的水平和趋势变化。方法：收集广西南宁市两区一县17家实行国家基本药物制度乡镇卫生院2009～2011年连续36个月的月服务量和患者费用数据，使用分段时间序列回归分析估计国家基本药物制度前后乡镇卫生院医疗服务的变化，并结合关键人物访谈资料进行分析。结果：国家基本药物制度实施后，乡镇卫生院门急诊人次和出院人数水平增加趋势减小，门诊病人次均药品费用和出院病人人均药品费用水平下降趋势不变，门诊病人次均医疗费用水平不变趋势增加，出院病人人均医疗费用水平下降趋势增加。结论：国家基本药物制度实施后，禁止使用非基本药物而基本药物无法满足用药需求导致乡镇卫生院服务量出现下降，住院服务相对门诊服务受到更大冲击；患者药品费用下降，但医疗费用出现增加，患者看病负担并未减轻，可能与乡镇卫生院增加医疗服务种类和数量有关。