【摘 要】
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基因组精简的主要步骤包括：①掌握菌株全基因组数据背景；②菌株的生物信息学分析(必须基因、基因组岛、复制起始位点等)；③建立大片段无痕敲除基因序列的方法；④利用所构建的方法进行基因组精简；⑤检验所构建的小基因组菌株生长和合成产物状况。完成了Bacillus amyloliquefaciens LL3的全基因组测序(1)，在此基础上进行了生物信息学分析，分析结果显示出：该菌株缘由基因4325个，必须基
【机 构】
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南开大学分子微生物与技术教育部重点实验室,天津300071
【出 处】
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第八届全国微生物资源学术暨国家微生物资源平台运行服务研讨会
论文部分内容阅读
基因组精简的主要步骤包括：①掌握菌株全基因组数据背景；②菌株的生物信息学分析(必须基因、基因组岛、复制起始位点等)；③建立大片段无痕敲除基因序列的方法；④利用所构建的方法进行基因组精简；⑤检验所构建的小基因组菌株生长和合成产物状况。完成了Bacillus amyloliquefaciens LL3的全基因组测序(1)，在此基础上进行了生物信息学分析，分析结果显示出：该菌株缘由基因4325个，必须基因273个；基因组岛约10个；复制起始位点在3994731-3994423之间；本研究组建立了利用温敏质粒结合反向筛选标记的大片段无痕删除基因序列的方法(2)；研究组利用所建立的方法对基因组进行了精简，共计删除了约10％的基因组序列。
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