SNP全基因组高分辨染色体微阵列分析技术在产前诊断中的应用

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目的评价SNP全基因组高分辨染色体微阵列分析技术在产前诊断中的临床应用价值。方法:201 4年4月至2015年4月,430例有超声结构异常、不良生育史或家族史、高龄、筛查高风险等产前诊断指标的产前样本,进行了SNP全基因组高分辨染色体微阵列(Affymetrix Cytoscan 750K芯片)检测,通过Chromosome Analysis Suite软件的分析及数据库的比对,分析拷贝数变异(CNV)及单核苷酸多态性(SNP)的情况。结果:430例产前样本,包括321例羊水,89例绒毛,20例脐血,共检出75例异常,总的异常检出率为1 7.4%,除24例非整倍体(异常率5.6%)外,SNP全基因组染色体微阵列分析技术还检测出45例异常CNV,1例三倍体,4例单亲二倍体(UPD)或杂合性缺失(LOH)和1例嵌合体(嵌合比例约为20%),将异常检出率提高了1 1.8%。在430例产前样本中,超声结构异常、不良生育史及家族史、高龄、筛查高风险的样本分别为334例(77.7%),27例(6.3%),29例(6.7%),40例(9.3%),异常检出率分别为20.1%,14.8%,10.3%,2.5%,除非整倍体外,还增加了对CNV,三倍体,单亲二倍体(UPD)、杂合性缺失(LOH)及嵌合体的检测,检出率分别提高了13.7%,1 1.1%,3.4%,2.5%。在超声结构异常中,异常检出率由高至低排列的超声指征依次为:多发畸形(78.3%),中枢神经系统异常(28.6%),颈项透明层(NT)增厚及淋巴水囊瘤(26.3%),泌尿系统异常(1 2.3%),颜面部异常(1 1.8%),心血管系统异常(7.7%)。结论:SNP全基因组高分辨染色体微阵列技术,在产前样本(特别是超声结构异常的样本)的检测中,不仅增加了对亚显微非平衡性微小改变(CNV)的检出,而且结合SNP探针,还能额外发现三倍体、单亲二倍体(UPD)及杂合性缺失(LOH)、隐匿性低水平嵌合体等异常情况,为遗传咨询提供指导。
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