【摘 要】
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C型凝集素是一个具有糖识别结构域的超家族,在无脊椎动物的先天免疫中起着重要作用.根据本实验室的转录组数据,运用RACEPCR的方法首次扩增出池蝶蚌C型凝集素全长cDNA,并
【机 构】
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南昌大学生物科学系,江西南昌330031
【出 处】
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第八届南方六省(粤、湘、鄂、赣、桂、琼)动物学学术研讨会
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C型凝集素是一个具有糖识别结构域的超家族,在无脊椎动物的先天免疫中起着重要作用.根据本实验室的转录组数据,运用RACEPCR的方法首次扩增出池蝶蚌C型凝集素全长cDNA,并利用相关生物学软件对其基因序列、氨基酸序列、蛋白结构域以及二级结构测进行分析及预测.结果表明,池蝶蚌C型凝集素的cDNA全长为1716bp,包括一个726bp的开放阅读框,编码241个氨基酸；其分子量约为27.80KD,理论等电点为5.96,氨基酸组成成分中丝氨酸(Ser)含量最高；对蛋白结构域分析得知,在N端第125到239个氨基酸区域具有一个完整CLECT(C-type-lectin,CTLorcarbohydraterecognitiondomain,CRD)结构域；通过二级结构预测得知,C型凝集素二级结构中,无规则卷曲最多,其次为α-螺旋和延伸链,β-转角最少.建立的系统进化树结果表明,池蝶蚌C型凝集素基因序列总体与其它动物的C型凝集素亲缘性较低,与斑节对虾(Penaeusmonodon)和中国对虾(Fenneropenaeuschinensis)共一分支.
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