微生物的抗生素耐药性就是指微生物能够在抗生素存在的情况下生长和繁殖.抗生素耐药性是环境微生物固有的,即所谓的内在抗性(intrinsic resistance),但是人类大量使用抗生素带来的抗生素抗性基因的扩散和传播已经普遍存在,且已经开始威胁到全球人群的健康.微生物对抗生素的抗性主要有三个机制：1)抗生素的外排；2)抗生素的降解或修饰；3)抗生素作用位点的保护.大量研究表明抗生素的使用和抗生素抗性的蔓延呈现良好的相关性,而且环境微生物的抗性可以通过基因横向转移(Horizontal gene transfer,HGT)向人类致病菌扩散,最终可能超级细菌的爆发,直接影响人类健康.2006年Pruden等明确提出微生物对抗生素的抗性是一类新兴的污染物,传统的污染治理技术尚没有考虑这类独特的污染物.为了应对全球性的抗生素抗性问题,我们必须加强：1)全球抗生素使用和环境排放的监管的政策和管理体系；2)建立快速和透明的抗生素耐药性监测体系,该监测体系应该涵盖医院、养殖业、污水处理厂；3)建立抗生素药物创新基金,通过政府和企业的联合,加快新型药物的研制；同时加强知识产权保护,是新药创制走上可持续之路；4)加强抗生素耐药性相关的基础与应用研究,包括耐药性发生和传播的生态学机制,消除和缓解耐药性发生和传播的环境技术及其系统解决方案等,包括改进污水处理厂的处理工艺,削减出水中抗性基因和抗性菌的比例；5)加强抗生素耐药性的科普宣传,提高全社会对耐药性的认知能力,从而在源头上有效控制抗生素在农业和医疗方面的滥用及其环境污染.