厌氧氨氧化(anaerobic ammonium oxidation,anammox)在海洋氮循环中起了关键作用,而有关anammox菌在淡水生态系统中的分布、种群多样性及活性的报导并不多,为更好地了解淡水生态系统中anammox菌的分布和种群多样性状况,本研究利用分子生物学技术检测了钱塘江底泥中anammox菌的分布。16S rRNA系统发育分析表明,钱塘江底泥中的anammox菌种群多样性水平较高,明显高于目前已报道的淡水环境,检测结果发现Brocadia,Kuenenia,Scalindua属以及三个新的anammox菌属存在被检的样品中。与海洋底泥不同(海洋底泥中Scalindua属的anammox菌占主导地位),钱塘江淡水底泥中Brocadia和Kuenenia属的anammox菌明显占优。相关性分析表明,有机质含量是影响anammox菌在钱塘江底泥分布和种群多样性的主要环境条件。