香灰菌基因组完整图的解析及其降解木质素和纤维素相关基因的初步研究

被引量 : 0次 | 上传用户:zjxydn
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
香灰菌是银耳的伴生菌,为银耳子实体的生长和发育提供营养物质。本研究以银耳主栽品种中的香灰菌TJAS01作为出发菌株,为研究其降解基质中木质素、纤维素相关基因的功能做以下三方面工作。1)采用Pacbio测序技术、长片段PCR等手段对TJAS01进行全基因组测序和拼接,获得其完整的基因组序列:香灰菌基因组为38.90 Mb,包含10条染色体和一个环状的线粒体DNA(没有gap,不存在多余的reads)。2)利用全基因组数据,预测出香灰菌中CAZyme相关基因有437个;通过转录组测序,获得这些CAZyme相关基因中有36个在木屑培养基(20天和32天取样)和马铃薯葡萄糖培养基(固体和液体培养基)中均未表达(拟假基因),114个木屑培养基和马铃薯葡萄糖培养基中表达差异显著,其中25个基因在木屑培养基中的表达量是马铃薯葡萄糖中的20倍以上(FPKM值)。3)采用PEG介导至原生质体的方法,将荧光蛋白基因导入香灰菌TJAS01中,并敲除了香灰菌基因组中的KU70和KU80基因,从而成功构建了香灰菌的外源基因转化和基因敲除体系,为其木质素和纤维素降解基因研究提供技术支撑。
其他文献
通过分析当前歙县茶产业现状以及存在的问题,提出促进该地区茶叶产业提升对策,包括推进茶树良种引进、土地流转、茶园基础设施建设、茶农培训,提升茶园效益,提升茶叶加工水平,实施
目的总结脾脓肿的临床资料,提高对脾脓肿的认识.方法回顾性总结我院1995年至2005年收治的22例脾脓肿的一般资料、诊断、治疗及预后.结果 22例患者中,痊愈7例,好转12例,死亡或
未成年子女是独立的权利主体,人们应该尊重他们的法律地位,保护他们的利益。未成年子女最佳利益原则是保障未成年子女利益实现的最高准则。这一原则要求人们在立法、执法时要
行为保全属于民事保全的一种,是民事诉讼中的一项重要法律制度。这一制度不但有着古老的历史,在当今也为许多重要国家的民事诉讼立法所规定。行为保全制度具有重要的价值。行
伴随着当今世界科技日新月异的发展和全球一体化进程的加快,科技新闻在广大读者的社会工作及生活中占据着越来越重要的地位。如何把国外先进的科技发明及信息动态及时准确而
曾几何时,观看美剧陪审团组长起立说出“We find thedefandent……发”,就会莫名的紧张,似乎比案件当事人还要更加迫切地知晓究竟是“not guilty”还是"guilty",每每此时心中
天津长芦海晶集团有限公司通过产学研合作,成功开发提溴自动控制技术产业化技术,于2014-11-22经天津市工业和信息化委员会组织的专家鉴定,项目技术水平达到国际领先水平。近
当人脸图像中存在较大比例的光照变化或遮挡时,PCANet所采用的局部零均值预处理以及PCA滤波器对噪声的过滤作用将导致所生成的特征图的整体分布主要集中在0附近,在一定程度上
公益信托从其出现到今天已有400年历史,在社会公益事业中始终扮演著重要角色,尤其在信托发源地英国,自从创制了这一法律制度之后,就在推动慈善事业的发展中发挥著举足轻重的
20世纪初,语言学研究发生了转向——从语言内部研究语言到从语言外部来关注语言。或者说,通过研究语言来看语言与人的关系、与世界的关系。隐喻作为语言中的一种普遍现象,古