【摘 要】
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对人工合成甘蓝型油菜的早期世代(F1-F4)以及它们的二倍体亲本白菜型油菜和甘蓝的全基因组表达谱进行了数字基因表达谱分析.使用Illumina技术总共获得42,000,000标签,大
【机 构】
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扬州大学/江苏省作物遗传与生理重点实验室,江苏扬州,225009
【出 处】
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中国作物学会油料作物专业委员会第七次会员代表大会暨学术年会
论文部分内容阅读
对人工合成甘蓝型油菜的早期世代(F1-F4)以及它们的二倍体亲本白菜型油菜和甘蓝的全基因组表达谱进行了数字基因表达谱分析.使用Illumina技术总共获得42,000,000标签,大约25959个基因的表达,白菜型油菜基因组中可注释63％的标签.超过56％的基因被翻译,表明在多倍化过程中RNA介导的基因调控的重要性.白菜型油菜、甘蓝、F1-F4代人工合成甘蓝型油菜和自然生长的甘蓝型油菜的序列标签与白菜型油菜全基因组进行序列比对,分别为19023、18547、24383、20659、18881、20692和19955个注释基因.将在文库中明确比对到的基因进行功能分类.数以千计的差异表达基因(DEGs)被鉴定,并且在F1-F4代中的表达量存在差异.差异最多的20种表达基因表达的蛋白主要包括DNA转录因子,细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶,环氧双加氧酶和富含甘氨酸蛋白.KEGG分析DEGs结果表明大约涉及120个生物通路.
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