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6-甲基腺嘌呤(m6A)修饰是真核生物mRNA中一种高丰度表观转录组学修饰,但它的特征、调控机制、在细胞重编程中的功能还很不清楚。在合作研究中,我们鉴定了四种类型的多能性细胞(干细胞、诱导性多能干细胞、神经干细胞、睾丸支持细胞)的转录组水平m6A修饰谱,通过比较分析发现多种m6A特征,特别是基因和细胞类型特异性的mRNA m6A修饰；发现操纵microRNA的表达或者突变microRNA序列都能影响m6A的生成,证明microRNA通过序列互补性调控m6A甲基转移酶亚基METTL3结合microRNA的靶标mRNA的能力来调控m6A甲基化的生成。另外,m6A修饰也可以调控Oct4、Sox2、Nanog多能性因子的表达,促进小鼠胚胎成纤维细胞(MEF)重编程。上述研究结果揭示microRNA调控mRNA m6A甲基化选择性机制,为m6A修饰在细胞重编程方面的功能研究提供了基础。