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面对基因组学等生物医学数据量的迅猛飙升，科研机构面临着巨大的数据存储和分析需求。云计算是网格计算、分布式计算和并行计算的发展，开源云系统在满足研究机构需求方面具有巨大的前景。介绍了云计算框架的基本概念和主要的开源云计算平台、目前最知名的云计算开源系统Hadoop框架及其核心技术以及云计算框架在生物信息处理中的应用和典型案例，最后讨论了开源云计算系统的问题和发展。