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水稻抽穗期是一个重要的农艺性状,它决定了水稻品种区域和季节的适应性,同时又直接或间接地影响水稻的产量和品质,其遗传受数量性状基因(QTL)的控制。本研究中发现,染色体片段代换系N22-1 (以籼稻品种9311为供体,粳稻品种日本晴为受体)的抽穗期,在长日照条件下较日本晴提前3-4天;在短日照条件下则无显著差异。由N22-1的高通量测序图谱可知,N22-1只在第2染色体短臂上携带一个导入片段。由此推测,N22-1导入的供体片段中可能携带微效的早抽穗基因。随后构建了相应的遗传分离群体。抽穗期及基因型分析表明,F2分离群体中抽穗期呈现1:2:1遗传分离比(X2=4.84 <X20.05,2=5.99),且F2分离群体中携带供体片段单株的抽穗期较日本晴显著提前。由此可知,N22-1导入的供体片段中含有一个不完全显性的早抽穗基因,暂时命名为q Hd2-1。随后基于染色体片段替代作图的方法将q Hd2-1精细定位在分子标记STS2-20和STS2-22之间,物理距离~105kb;结合分子标记辅助选择构建了包含~560 kb供体片段的近等基因系。近等基因系农艺性状调查结果表明,q Hd2-1除引起植株抽穗期显著提前外,近等基因系的株高、分蘖数、剑叶长以及千粒重等农艺性状均较日本晴显著降低,降低的比例分别为11.05%, 14.4%, 10.86%和8.29%。除此只外,本研究中还明确了q Hd2-1通过直接调控抽穗基因Hd3a和RFT1的表达进而参与抽穗期的遗传调控。相关研究结果有助于为进一步克隆该基因、阐明抽穗期的遗传机制,为分子设计高产水稻品种提供基因资源。