【摘 要】
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[目的]获得cfr基因阳性大肠杆菌IncA/C质粒pSCEC2的全核酸序列,并分析cfr基因的遗传背景及新的传播方式.[方法]2010年从猪场分离到1株cfr基因阳性大肠杆菌,通过S1-PFGE、Southern杂交、接合转移试验、电击转化和质粒复制子分型等方法对pSCEC2质粒进行研究；同时采用454 GS-FLX测序仪对pSCEC2质粒进行序列全测定.[结果]最终获得一个全长为135,615
【机 构】
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中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室/细菌病研究室,黑龙江哈尔滨 150001
【出 处】
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2013年中国畜牧兽医学会兽医药理毒理学分会第十二次学术讨论会
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[目的]获得cfr基因阳性大肠杆菌IncA/C质粒pSCEC2的全核酸序列,并分析cfr基因的遗传背景及新的传播方式.[方法]2010年从猪场分离到1株cfr基因阳性大肠杆菌,通过S1-PFGE、Southern杂交、接合转移试验、电击转化和质粒复制子分型等方法对pSCEC2质粒进行研究；同时采用454 GS-FLX测序仪对pSCEC2质粒进行序列全测定.[结果]最终获得一个全长为135,615 bp的pSCEC2,该质粒含有200编码大于100个氨基酸的开放阅读框.序列分析显示,pSCEC2质粒含有两个耐药基因簇,分别为floR耐药区和cfr耐药区.由cfr和两个转录方向相同的IS256插入元件组成的一个4.4 kb的片段,其中IS256被认为与cfr基因的转移有关.另一个耐药区包含floR、tet (A)-tetR、strA/strB和sul2耐药基因,该耐药基因簇在之前发现的其他IncA/C类型的质粒中都有发现.除了这2个耐药基因簇外,pSCEC2的质粒骨架和其他IncA/C类型的质粒骨架和核酸序列同源性＞99％.[结论]首次在宿主范围广、转移能力强以及稳定的IncA/C家族质粒中发现了多重耐药基因cfr,pSCEC2质粒将加速cfr基因的传播.cfr的基因环境分析表明,cfr基因两端各有一个完整的IS256插入元件,而且反向PCR也能得到由cfr和其中一个IS256组成的环状结构,这也再次提示IS256可介导cfr基因的移动.
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