【摘 要】
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由于连锁不平衡(Linkage disequilibrium,LD)在定位重要经济性状的功能基因上的实用性,最近已经受到巨大的关注.关联分析的可行性和高效性依赖于LD水平,而LD水平决定关联分析中使用群体的标记数量和密度以及实验设计.在本研究中,我们首次调查了太平洋牡蛎(Crassostrea gigas)野生和选育群体的LD水平.在全基因组范围内采用53个微卫星,分别分析了88个野生个体和96个
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由于连锁不平衡(Linkage disequilibrium,LD)在定位重要经济性状的功能基因上的实用性,最近已经受到巨大的关注.关联分析的可行性和高效性依赖于LD水平,而LD水平决定关联分析中使用群体的标记数量和密度以及实验设计.在本研究中,我们首次调查了太平洋牡蛎(Crassostrea gigas)野生和选育群体的LD水平.在全基因组范围内采用53个微卫星,分别分析了88个野生个体和96个选育个体的LD水平.野生群体中,没有显著的线性标记间的关联被检测到,但是选育群体中发现了3个, LD衰退距离为12.7 cM,暗示了在选育群体中,强烈的人工选择是一个大幅提高基因组LD水平的关键因素.野生和选育群体在LD上的差异表明,可以通过选择不同的关联分析群体以合理的标记密度较低的花费来实现太平洋牡蛎的关联分析.而且,非共线性标记间的LD和稀有等位基因的频繁出现也表明：定位牡蛎基因的时候,采用连锁分析和连锁不平衡分析相结合的策略将更为有效.
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