【摘 要】
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本试验以小反刍兽疫病毒Nigeria75/1株为研究对象,通过RT-PCR法扩增P基因,利用DNAStar软件包中的Editseq将Nigeria75/1株苷酸序列翻译成氨基酸序列,然后利用Protean软件对其氨基酸序列进行分析,预测P蛋白的二级结构及B细胞抗原表位.结果表明,在Nigeria75/1株P蛋白的509个氨基酸序列中,多个区域有较好的亲水性、表面可及性和较高的抗原指数,尤其是在N基
【机 构】
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中国农业科学院 北京畜牧兽医研究所动物营养学国家重点实验室,北京100193;西藏职业技术学院,拉萨850030
【出 处】
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中国畜牧兽医学会信息技术分会2013年学术研讨会
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本试验以小反刍兽疫病毒Nigeria75/1株为研究对象,通过RT-PCR法扩增P基因,利用DNAStar软件包中的Editseq将Nigeria75/1株苷酸序列翻译成氨基酸序列,然后利用Protean软件对其氨基酸序列进行分析,预测P蛋白的二级结构及B细胞抗原表位.结果表明,在Nigeria75/1株P蛋白的509个氨基酸序列中,多个区域有较好的亲水性、表面可及性和较高的抗原指数,尤其是在N基端,可能是潜在的B细胞优势抗原表位,为分析P蛋白的生物学功能奠定了基础.
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