酵母基因上游中二聚体寡核苷酸转录调控位点的分析

来源 :2006年中国科学院智能计算与生物信息学学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:dfvgb345g33
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前期对酵母基因上游序列的分析结果显示高效转录基因上游的序列在长度、寡核苷酸使用、以及寡核苷酸在序列中的分布等方面都有着区别于低效转录基因上游序列的特征,而且高效转录基因上游序列中含有较多潜在的转录因子结合位点。观察实验获得的转录调控位点,发现许多调控位点不是相邻接的寡核苷酸,而是由一对被非保守区域间隔开的寡核苷酸构成。于是对二聚体寡核苷酸(dyad)在高效和低效转录基因上游序列中出现的频率进行统计比较分析,抽提出在高效转录基因上游序列中出现的频率显著高于在低效转录基因上游序列中出现频率的二聚体寡核苷酸,并分析这些二聚体寡核苷酸在两组转录基因上游序列中的分布特征,与实验结果相对照,这些二聚体寡核苷酸有可能与基因转录的正调控有关。
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