Search of the conformations of peptide by ab initio method and ABEEMσπ polarizable force field

来源 :第十三届全国量子化学会议 | 被引量 : 0次 | 上传用户：liur8888

【摘要】

：

　　Peptides and proteins are ubiquitous around all organisms,and their functionalities depend on the characteristic configuration strictly.To obtain an accurat

【作者】

：

Zhang Chao Zhao Dong-Xia Yang Zhong-Zhi

【机构】

：

School of Chemistry and Chemical Engineering,Liaoning Normal University,Dalian 116029,China

【出处】

：

第十三届全国量子化学会议

【发表日期】

：

2017年期

下载到本地 , 更方便阅读

下载此文赞助VIP

声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架

论文部分内容阅读

　　Peptides and proteins are ubiquitous around all organisms,and their functionalities depend on the characteristic configuration strictly.To obtain an accurate potential energy surface(PES),as well as to locate all minima are both challenging issues.

其他文献

发展应用于DNA体系的ABEEMσπ极化力场

　　DNA 在人体生命活动中起着至关重要的作用,DNA 结构的稳定性主要靠氢键与堆叠作用维持。要准确模拟DNA 体系中的这两种作用首要是准确模拟体系的极化效应和电荷转移效应

会议

发展应用DNA模拟体系极化效应转移效应生命活动稳定性人体

应用ABEEMσπ/MM对赖氨酸稳定结构研究

　　在运用ABEEMσπ/MM[1]探究赖氨酸二肽稳定构象中，调节了模型分子支链上二面角参数，将已调好的二面角参数直接转移到三肽上，来保证研究体系的参数一致性。

会议

赖氨酸稳定构象角参数直接转移一致性体系探究三肽

应用ABEEMσπ/MM方法探讨甘氨酸和苏氨酸的稳定构象

　　本文本文在Gaussian09 量子化学软件和GaussView5.0 可视化软件中应用B3LYP/6-311++G(d,p)方法对甘氨酸及苏氨酸二肽、三肽分子结构优化,并以从头算B3LYP/6-311++G(d,p)

会议

方法甘氨酸苏氨酸稳定构象B3LYP三肽平均绝对偏差分子结构优化

应用ABEEMσπ/MM探索天门冬氨酸二肽三肽的稳定构象

　　本文应用ABEEMσπ/MM[1]浮动电荷极化力场方法,对天门冬氨酸[2]二肽和三肽结构进行扫描优化,并对其构象进行总结分类,得到其相应的9 组二肽和50 组三肽的稳定构象。结果

会议

天门冬氨酸二肽三肽稳定构象方法计算结果电荷极化一致性

应用ABEEMσπ/MM方法探究半胱氨酸多肽的稳定结构

　　本文应用浮动电荷极化力场ABEEMσπ/MM[1],以天然氨基酸中半胱氨酸二肽、三肽为模型分子调节其支链二面角参数V1、V2 与V3,调节后以从头算的计算结果为蓝本进行对比,得

会议

方法探究半胱氨酸多肽天然氨基酸稳定构象三肽计算结果分子调节

发展适用于8-oxo-G与氨基酸残基相互作用体系的ABEEMσπ极化力场

　　为使遗传信息保持完整,修复酶会自动修复受损DNA[1,2],这一微观机制的关键是修复酶相应残基与氧化碱基间复杂的氢键相互作用[3,4]。基于ABEEMσπ极化力场(ABEEMσπ PFF

会议

氨基酸残基相互作用体系极化修复酶氢键相互作用二面角重新定义氧化

卤素离子水溶液体系的从头计算和ABEEM浮动电荷分子力场研究

　　采用量子化学方法计算X-(H2O)n(X-=F-/Cl-/Br-/I-,n=1～6)团簇体系的结构、结合能和电荷分布。结果表明,团簇体系最稳定构型是H2O 中H 直接与卤素离子配位；当外层配位水分子

会议

卤素离子水溶液体系从头计算电荷分布相互作用水分子数量子化学方法最稳定构型

应用ABEEMσπ浮动电荷力场和从头算方法研究CH3COAla-Pro-TyrNHCH3四肽水溶液中的结构和性质

　　通常人体中的化学反应是在水中进行的,氨基酸作为构成蛋白质的基本单位,研究其在水溶液中的各种性质就显得尤为重要。本文对CH3COAla-Pro-TyrNHCH3 四肽进行研究,先在B3L

会议

电荷力场从头算方法研究四肽水溶液结构稳定构象

探索有机小分子的稳定构象

　　本文应用ABEEMσπ/MM 方法，探索有机小分子稳定构象.该方法能够快速获得与从头算B3LYP/6-311++G(d.p)方法相同的稳定构象数目，并且二者得到的骨架二面角十分接近.

会议

有机小分子稳定构象方法二面角从头算B3LYP象数骨架分接

Theoretical method and mechanism study of potential energy surface of solid to solid phase transitio

　　Phase transition is the important part of material science research,which occurs throughout the microscopic to macroscopic world and has a significant effec

会议

Search of the conformations of peptide by ab initio method and ABEEMσπ polarizable force field

与本文相关的学术论文