身心整合概念是将人的精神心理和躯体功能看作相互影响、不可分割的整体。它意味着心理的变化常常能在生理上体现。例如，情绪的变化直接影响认知，进而能促进或减弱语言、运动等躯体功能。大多数接受神经康复治疗的患者经历过重大的精神创伤和身体创伤；运动、语言、认知、社交功能的丧失，和生活的巨大改变，常常引起患者的负性情绪状态，如：抑郁、焦虑、愤怒等。患者对其的应对，将很大程度的影响康复治疗的进展和效果。音乐治疗是一种全面的、整合性的治疗方式。在治疗师对患者的评估的中，关注患者的诊断和治疗背景、躯体状况、心理功能水平、家庭社交背景等；观察患者的精神心理状态与躯体功能如何互相影响和作用。音乐治疗师在全面评估后制定治疗方案：以促进患者身心的协调和完整性为目的，同时改善临床中凸显的功能性损伤。例如，在面对伴有语言损伤的患者时，治疗师在运用神经音乐治疗中旋律音调治疗(MIT)等方法的同时，关注患者的情绪、认知、社交等心理功能。通过音乐心理治疗的多种方法，改善患者的心理功能水平，减少其对躯体功能康复的阻碍，从而达到身心在一定程度上的协调和完整，进而获得更佳的康复治疗效果。