原核生物分枝杆菌属中广泛存在一种类似真核生物泛素-蛋白酶体系统的蛋白降解系统,即类泛素-蛋白酶体系统(Pup-proteasome system,PPS),即在辅助因子蛋白酶体关联ATP 酶(Mycobacterium proteasomal ATPase,Mpa)、蛋白酶体辅助因子A (proteasome accessory factor A,PafA)和Pup 脱酰胺酶(deamidase of Pup,Dop)等的作用下,将底物蛋白传递到蛋白酶体内进行降解或者参与广泛的调控作用。其中Pup 标记的靶蛋白广泛参与了信号通路、脂类代谢以及细胞壁/膜的合成等细菌生命活动的各个环节,多个与此系统相关基因的突变会导致结核分枝杆菌对NO 敏感性增加,同时降低了结核分枝杆菌的存活率。基因敲除技术为结核分枝杆菌毒力基因功能的研究、耐药性产生机理、抗结核分枝杆菌药物筛选及疫苗候选分子的选择等提供了一个有力的工具。以往的研究发现Mtb 蛋白酶体辅助因子(proteasome accessory factor A,PafA)在Pup-蛋白酶体系统中发挥着关键因素,PafA 的突变可以造成底物蛋白的累积,同时检测不到Pup 标记蛋白的存在,说明PafA 对于Pup 与靶蛋白的连接是必需大的,同时发现PafA 敲除或突变可导致结核分枝杆菌蛋白酶体系统抗活性氮中间体(RNI)的能力减弱。因此,越来越多的研究者希望通过PafA 的敲除来发现一些潜在的与细菌的毒力或者致病性甚至一些药敏性的变化来进一步揭示PafA 的作用机理。