滇重楼[Paris polyphylla,mith var.yunnanensis(Franch.)Hand.-Mazz.]为百合科重楼属多年生草本植物,以根茎入药,是我国常用的传统中药.作为西南地区道地药材,滇重楼具有较强的生理和药理活性,广泛应用于临床.然而,滇重楼药材主要来自野生资源,同时其根茎生长缓慢,加之逐年过度采挖使野生滇重楼资源面临枯竭.植物内生菌在与植物长期协同进化的过程中相互依存和相互作用,不仅对宿主植物有促进生长、防止病害和内生固氮等有益的生物学作用,而且基因的转移或植物成分的诱导,使内生菌产生具有与宿主相同或相似的生理活性物质,是具有极大开发价值的生物资源.因此,植物内生菌已成为微生物生态学、资源学、代谢产物化学等学科的研究热点.本研究围绕滇重楼根茎内生细菌的多样性这一基本科学问题,以采自云南各地区的滇重楼为对象,通过选择性分离培养技术和高通量测序技术两种方法策略,对滇重楼内生细菌资源进行分析和挖掘.研究发现：来自云南省大理州、红河州、临沧、丽江等地区的滇重楼根茎样本中,纯培养细菌主要分布于3个门(数据来自286株内生细菌的16S rRNA基因序列分析)：变形杆菌门(分属20个属),厚壁菌门(分属9个属),放线菌门(分属16个属)；经多相分类鉴定获得9个候选新分类单元(分属于Rhizobium,Bacillus,Oceanobacillus,Yimella,Paenibacillus)；5个样点(楚雄,个旧、弥勒,耿马,中甸)根茎及其根际土壤样品的MiSeq测序数据分析结果表明根际土壤细菌的多样性明显高于根茎内生细菌,有更多稀有类群被检测到.然而根茎内生环境主要由三大主要细菌类群组成,这与纯培养的结果一致.此外、不同分布区样本的内生细菌群落结构表现出了不同,而不同分布区土壤细菌群落结构的差异则并不明显,表明不同分布区的重楼品种差异对其内生细菌的群落结构存在显著的影响.