不同饲养方式下雏鸡肠道菌群的PCR-DGGE分析

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目的本实验通过测定笼养和散养雏鸡肠道微生物种类,分析不同饲养方式对雏鸡肠道微生物结构的影响。材料方法随机取5只笼养和散养8周龄蛋雏鸡剖杀,取全部小肠,将5只鸡的十二指肠、空肠、回肠和盲肠内容物分别混匀,提取样品基因组DNA,以细菌通用引物扩增样品16S rDNA高变区序列,对PCR产物的变性梯度凝胶电泳(DGGE)分析。结果结果显示,不同饲养模式的雏鸡不同肠道中菌群组成差别很大,从笼养雏鸡十二指肠、空肠、回肠和盲肠分别分离8株、12株、8株和9株菌,共属于20个菌属;散养雏鸡十二指肠、空肠、回肠和盲肠分别分离8株、13株、14株和9株菌,共属于23个菌属。笼养和散养雏鸡肠道鉴定出乳酸菌总共有7株,包括3株Lactobacillus aviaries(鸟类乳酸菌)、1株Lactococcus raffinolactis(棉子糖乳酸菌)、1株Lactobacillusagilis(敏捷乳杆菌)、1株Coprococcus comes(陪伴粪球菌)和1株Lactobacillus equigenerosi(同代乳杆菌);其中散养雏鸡的各个肠道均有的共同乳酸菌为1株,即Lactobacillus equigenerosi(同代乳杆菌);1株Lactobacillus aviaries和1株Lactococcus raffinolactis仅在笼养雏鸡的肠道中发现,分别分离自十二指肠和空肠、及盲肠,在散养雏鸡肠道中未发现;有1株Lactobacillus aviaries仅在散养雏鸡的回肠分离得到,在笼养雏鸡肠道中未发现。笼养雏鸡各肠道均有的非乳酸菌属共同菌为2株,即1株Rummeliibacillus stabekisii(鲁梅利杆菌)和1株Gardnerella vaginalis(阴道加德菌);散养雏鸡各肠道均有的非乳酸菌属共同菌为1株,即Paraprevotella clara(克拉副普氏菌);且散养雏鸡肠道中独有的非乳酸菌细菌有7株,分别为1株Acinetobacter lwoffii(洛菲不动杆菌)、1株Streptococcus gallolyticus(链球菌属)、2株Uncultured bacterium(不可培养细菌)、1株Clostridium sartagoforme(煎盘梭菌)和2株Streptomyces spiralis(螺旋链霉菌)。讨论同龄鸡肠道细菌种群结构与饲养方式和肠道的不同部位有关,笼养和散养蛋雏鸡肠道中细菌群落的组成差异很大,且散养较笼养丰富。
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