大弹涂鱼微卫星引物的开发

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  应用5-锚定PCR技术直接从大弹涂鱼基因组DNA中扩增SSR序列.采用PCR法快速筛选阳性克隆,随机挑取134个克隆进行测序,发现均含有微卫星序列,阳性克隆的得率达到了100%.设计出39对大弹涂鱼微卫星引物,其中27对扩增出具体的产物.通过九段沙大弹涂鱼群体60个体的测试,筛选出10对多态性引物,其微卫星序列的GenBank登入号为FJ598058~FJ598067.每个微卫星位点的等位基因数为3~14个,观察杂合度和预期杂合度的值分别介于0.2500~0.8500和0.3679~0.8692之间.本研究筛选的微卫星引物可以用于大弹涂鱼遗传背景分析和遗传连锁图谱构建,并将为大弹涂鱼基因组结构分析、标记辅助育种以及数量性状位点(QTL)基因的定位等研究提供候选微卫星标记.
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