【摘 要】
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干酪乳杆菌是乳杆菌属中革兰氏阳性、兼性厌氧的一个种,通常存在于生乳或发酵乳制品、人和动物的肠道、生殖系统以及新鲜蔬菜或发酵蔬菜制品中.为了更好地了解干酪乳杆菌的进化和系统发育关系,本研究以分离自不同地区的酸粥(46株)、泡菜(7株)以及自然发酵乳(177株)中230株干酪乳杆菌为研究对象,采用多位点序列分型的技术分析干酪乳杆菌不同分离株的遗传多样性.选用carB、clpX、dnaA、groEL、m
【机 构】
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内蒙古农业大学 乳品生物技术与工程教育部重点实验室,呼和浩特,010018
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干酪乳杆菌是乳杆菌属中革兰氏阳性、兼性厌氧的一个种,通常存在于生乳或发酵乳制品、人和动物的肠道、生殖系统以及新鲜蔬菜或发酵蔬菜制品中.为了更好地了解干酪乳杆菌的进化和系统发育关系,本研究以分离自不同地区的酸粥(46株)、泡菜(7株)以及自然发酵乳(177株)中230株干酪乳杆菌为研究对象,采用多位点序列分型的技术分析干酪乳杆菌不同分离株的遗传多样性.选用carB、clpX、dnaA、groEL、murE、pheS、pyrG、 recA、rpoC和uvrC等10个管家基因部分序列为等位基因靶点,建立干酪乳杆菌多位点序列分型技术.通过PCR扩增、测序,成功获取了10个选取的靶点序列.通过Bionumerics 6.0和eBURST V3软件包进行分析,230株干酪乳杆菌分离株共识别为174个序列型,组成21个克隆复合体.选取不同序列型代表性序列采用ClonalFrame软件进一步预测分析干酪乳杆菌分离株的种内重组事件,从预测同源重组区和重建克隆谱系表明这些分离株中有一定程度的同源重组事件发生,且不同分离源的菌株形成了不同的亚型,如分离自泡菜、酸粥和自然发酵乳中的干酪乳杆菌均形成了相对独立的亚型,显示出分离自不同生境的干酪乳杆菌有着不同的进化历程.干酪乳杆菌分离株的种群结构分析显示出其在表型和基因型都具有较高的多样性,但不同生境的分离株具有一定程度的特异性,充分表明不同生境的干酪乳杆菌有着不同的进化历程.
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