联合蛋白质组学和转录组学技术筛选非酒精性脂肪性肝病相关分子

来源 :The 14th Congress of Gastroenterology China(第十四届全国消化系病学术会议) | 被引量 : 0次 | 上传用户:yangjianwu2008
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  目的 以自发非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)的肝脏特异性NAD+依赖的去乙酰化酶SIRT1敲除(SIRT1-LKO)的小鼠为模型,联合蛋白质组学和转录组学技术筛选NAFLD相关的关键分子。方法 采用高脂饲料和正常饲料分别喂养SIRT1-LKO小鼠及同窝对照野生小鼠(WT)8周,检测4组小鼠的体质量、血糖变化,收集小鼠的血清及肝脏组织,通过肝组织HE染色和油红染色评价脂肪变程度,采用Q Exactive质谱仪检测肝脏组织蛋白表达,采用基因表达谱芯片检测肝脏mRNA表达。然后对差异表达的蛋白和基因进行GO和KEGG通路分析,运用生物信息学方法,结合转录因子预测软件,对获得的组学数据进行整合分析。结果 体质量、血糖、肝脏组织HE和油红染色结果表明,高脂饮食成功诱导NAFLD小鼠模型,并且高脂饮食SIRT1-LKO小鼠肝脏脂肪变更加严重,与文献报道一致。各组差异蛋白或基因的GO和KEGG分析显示炎症相关通路、钙离子信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)、过氧化物酶增殖物激活受体(peroxisome proliferater-aetivated receptor,PPAR)等信号通路参与了NAFLD的的发生、发展,其中PPAR通路已经得到证实。通过分析获得了一组SIRT1相关的参与NAFLD发生、发展的关键分子,并进行了初步的实时荧光定量聚合酶链反应(QPCR)和Western印迹法验证,结合预测软件,对这些关键分子上游的转录因子进行了预测,初步构建了SIRT1相关的调控NAFLD的分子网络。结论 以调控代谢的关键分子SIRT1作为切入点,联合蛋白质组学和转录组学技术,筛选到一组与SIRT1相关的参与NAFLD发生、发展的关键分子。
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