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红罗非鱼的体色变异一直是限制其集约化规模养殖的主要瓶颈.在此背景下,本研究构建了红罗非鱼各组织混合样品以及3 种不同体色红罗非鱼(粉白色,红斑、黑斑)皮肤组织的转录组.在总共56,741,505 条序列中,过滤组装出160,762 条转录本作为参考序列.其转录本序列与斑马鱼、河豚、清鳉以及尼罗罗非鱼的蛋白数据库有53.4%到 86.7%的匹配率.