肌间刺(Intermuscular bone)又称肌间小骨、肌间骨,位于椎骨两侧的肌间隔中,由肌隔结缔组织骨化而成。为了探究斑马鱼肌间刺发育调控机制,研究基于其不同发育时间点的肌间隔组织,20d左右的斑马鱼只有肌间隔,30d之后肌间隔逐渐骨化形成肌间刺。利用显微切割技术(microdissection)分离20d、25d、30d、35d和60d以上不同年龄斑马鱼的肌间隔、肌肉、硬骨和肌间刺。对不同组织和不同发育时间点的肌间隔的转录组进行综合分析,通过差异基因表达分析,总共发现有8298个基因在这五个时期发生了差异性表达。通过GO富集和KEGG功能聚类,确定了与钙离子通道、转录调控、跨膜转运体相关联的GO term,利用WGCNA(加权共表达网络分析)发现硬骨发育系列关键基因sp7、runx2、bmp2a、spp1和opg以及肌肉抑制因子在肌间刺发育过程中起到关键性作用。In situ hybridization结果表明,硬骨发育系列关键基因的荧光探针在肌间隔组织出现荧光,为后续研究斑马鱼肌间刺的发育通路提供了关键线索和思路。