本实验通过选取中国26个省(市)、六个稻区的453份选育品种,考察42个表型性状和进行36个微卫星位点分析,系统研究中国水稻选育品种的遗传多样性.在36个SSR位点共检测到452个等位基因,每个位点的等位基因数为2～23,平均多态性为12.6.与我们在地方种和野生稻上的研究结果相比,选育品种在多个位点上的遗传多样性都较低.不同类型、地理和年代的选育品种多样性分析表明:(1)籼稻品种和粳稻品种间存在着较大遗传差异,籼稻品种的遗传多样性大于粳稻品种的遗传多样性;(2)选育品种的遗传多样性地理分布是华中稻区遗传多样性最大,东北稻区和西北稻区遗传多样性最小.位于长江中下游的江苏、江西和西南地区的四川等地是中国水稻选育品种遗传多样性最大的稻区.东北地区作为重要的粳稻生产基地,遗传基础非常狭窄,应该发掘新的种质资源拓宽品种的遗传多样性;(3)从50年代到80年代我国选育品种的遗传多样性一直下降,80年降低到最低水平,90年代又有显著提高;(4)微卫星标记和表型性状分析多样性的结果具有很高的一致性,但是一致性会随所分析的品种数量的减少而降低.此结果将为中国水稻品种改良、资源收集和核心种质构建提供参考.