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协同创新是高技术产业创新模式未来的发展方向，也是促进产业发展的有效路径。在解析产业协同创新内涵及效用的基础上，分析了中国高技术产业协同创新理论体系的要素及结构，引入复合系统协同度模型，通过对2005-2010年相关数据的处理，分析中国高技术产业创新的协同度。结果证明，中国产业创新主体及外部创新环境各自的有序度虽然有一定增长，但是创新体系整体协调度较低，且伴有较大波动，创新主体正逐步成为整体创新体系演进的主要动力。最后，提出了高技术产业协同创新的政策建议。