【摘 要】
：
以四川白鹅、豁眼鹅、莱茵鹅、朗德鹅、扬州鹅等5个鹅品种作为试验鹅群体,选用10个微卫星引物,经过基因组DNA的提取、PCR扩增、扩增产物的电泳分型、各座位等位基因分析以及基因频率、基因杂合度(H)和多态信息含量(PIC)的计算等步骤,从分子水平上分析上述5个国内品种、国外品种和培育品种的遗传变异.结果表明:5个鹅品种在10个微卫星座位上的基因频率存在一定差异,其平均基因杂合度为0.7081,平均多
【机 构】
：
江苏畜牧兽医职业技术学院,国家水禽种质资源基因库,江苏泰州,225300 扬州大学动物科学与技术学
论文部分内容阅读
以四川白鹅、豁眼鹅、莱茵鹅、朗德鹅、扬州鹅等5个鹅品种作为试验鹅群体,选用10个微卫星引物,经过基因组DNA的提取、PCR扩增、扩增产物的电泳分型、各座位等位基因分析以及基因频率、基因杂合度(H)和多态信息含量(PIC)的计算等步骤,从分子水平上分析上述5个国内品种、国外品种和培育品种的遗传变异.结果表明:5个鹅品种在10个微卫星座位上的基因频率存在一定差异,其平均基因杂合度为0.7081,平均多态信息含量为0.6618.其中,扬州鹅平均基因杂合度最高,为0.7568,遗传多样性最丰富;朗德鹅平均遗传杂合度最低,为0.6707.
其他文献
以13/17罗伯逊易位纯合子猪[2n=36,XY或XX,rob(13;17)]为实验材料,制备其有丝分裂中期染色体,利用显微分离技术时13/17罗伯逊易位染色体进行分离,并将单条染色体进行LA-PCR扩增,其扩增片段大小主要在0.2-2.2kb之间;对LA-PCR扩增产物用猪13、17号染色体近着丝点微卫星标记SWR1941和SWR1120与Southern杂交两种方法进行鉴定,结果表明LA-PC
解耦联蛋白家族(uncoupling proteins,UCPs)是线粒体内膜的转运蛋白,具有解离氧化磷酸化耦联的功能,影响机体能量代谢.本研究通过PGR和PCR-SSCP等方法,对UCP3基因进行多态性扫描并进行测序验证,在UCP3基因所扫描的区段中共发现并验证了6个多态性位点,然后对这6个多态性位点进行转录因子结合位点预测,结果表明,有4个突变位点改变了转录因子结合方式,对这4个多态性位点进行
基因分型错误已成为目前分子标记检测(如痕量样品分析、法医学鉴定)过程中愈发受到重视的问题.本文以微卫星DNA标汜检测为例,对分型错误的可能来源、错误发生率评价及其控制方案进行综述分析,为类似研究工作提供参考.
本文简介了几种遗传标记的特点,着重回顾了近年来分子标记在畜禽遗传资源保存和利用中的研究进展,包括:个体或品种鉴定、遗传图谱构建、功能基因定位、遗传标汜辅 助选择、分析动物起源与演化、分析遗传变异和亲缘关系、杂种优势预测等几个方面,这些研究可为资源保护及开发的实施提供理论依据.
PEG1在人和鼠上均为母系印记基因.本研究通过电子克隆及PCR扩增测序获得了该基因681bp的3非翻译区序列,该序列与人、小鼠PEG1基因的同源性为56.2％和69％.应用辐射杂种板对该基因进行了物理定位,结果将该基因定位于SSC18q13-21,与微卫星标记S0062紧密连锁(L0D=4.8).
通过对鸡催乳素基因编码区DNA序列分析,发现3个SNP.在五个鸡群中进行SSCP共发现7种单倍型,不同的单倍型有不同的密码子使用频率.结合44周龄产蛋量性状,发现不同单倍型的平均产蛋量存在显著差异.结合密码子使月频率分析,发现高频密码子的单倍型其产蛋量也相对高.ELISA检测结果也证实高频密码子个数越多的单倍型其激素水平越高.实验结果表明PRL基因密码子的使用频率是影响鸡产蛋量的重要因素.
利用PCR产物直接测序法,对五指山猪、滇南小耳猪、香猪、大白猪和梅山猪共60个样本的胰岛素样生长因子2基因5调控区部分片段的单核苷酸多态性进行了研究.结果找到10个SNP,分别是:C5872T、C5888T、A5976G、C6010T、T6029A、C6037T、C6043T、C6063T、C6112T和C6164T.所有位点均为二等位基因型,T6029A为T←→A碱基颠换,A5976G为A←→G
通过资源调查摸清我国8个重点保护地方鸭品种的保存现状,发现建昌鸭已经濒临灭绝.其他7个鸭品种均处于正常保种状态.通过筛选的28个多态性较好的微卫星标记,检测了我国8个重点保护地方鸭品种的遗传多样性.利用等位基因频率计算了各群体的遗传参数、构建了聚类图,并进行了系统发生分析.根据调查结果及遗传多样性检测数据,分析8个地方鸭品种的保存状态,并提出保护建议.
以鹅血清总DNA为模板,设计引物对鹅脂蛋白脂酶(lipoprotein lipase,LPL)基因的第4至第6外显子区域进行扩增.测序结果表明,鹅LPL基因第4外显子到第6内含子的片段大小为3404bp,鹅LPL基因第4至6外显子序列与鸡LPL同源性达到91.9％,与人、羊、牛、猪等哺乳动物同源性在74％-77％之间.核酸进化树显示,鹅鸡较早地与哺乳类动物分化开来.分析了该区域编码氨基酸的亲水性、
本研究以肌苷酸合成代谢过程中主要的催化酶之一的鸡腺苷单磷酸脱氨酶1(AMPD1)基因作为候选基因,分析了其在6个鸡种中的序列多样性,发现在525bp的片段中共存在10个多态位点,其中120位的A→G、355位的A→G的碱基变化仅在泰和乌骨鸡、北京油鸡、茶花鸡肌苷酸含量较高的鸡种中出现,推测这两个位点与肌苷酸含量密切相关.另外该基因与体重也可能具有相关性.