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本文提出了一种快速分析计算化学类应用运行特征的方法，准确提供F/M(浮点计算量与内存访问的比值)和F/C(浮点计算量与网络通信量的比值)等数值结果，通过定量数据确定应用类型，方便快捷的获取应用程序在机群系统上运行的详细过程，辅助专家快速定位系统瓶颈、为进一步的源代码级性能优化确定修改方向和修改建议，同时为应用的机群选型提供方案。