根据全国重要河湖健康评价体系从水文水资源、物理结构、水质、生物和社会服务等五个准则层和17个指标层对2011年的太湖健康状况进行评价,结果显示,太湖处于亚健康状态。17个评价指标中,最低生态水位满足状况、溶解氧状况、耗氧有机物状况以及防洪能力等4个指标的评价得分较高,都大于90分;浮游植物数量、鱼类损失指数、水功能区达标率、水体富营养化状况、底栖动物生物完整性指数和公众满意度等6项指标得分较低,都低于60分,其中浮游植物数量评价仅得22.0分,反映出太湖现阶段较差的水质状况。太湖的健康管理需要继续加大太湖水环境综合治理力度,实行最严格的水资源管理制度,控制湖泊的外源污染,同时降低湖泊的内源释放,改善太湖水质状况,在保证东部水域草型湖泊生态系统稳定的前提下在局部藻型湖湾开展生态修复试点工作,以点到面,最终实现全湖性生态恢复,提高太湖健康水平。